MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187097	CCAG	2	8	56	63	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187097	CGAT	2	8	233	240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187097	CA	3	6	422	427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187097	GCC	2	6	440	445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187097	GTT	2	6	530	535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187097	TTC	2	6	537	542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187097	T	6	6	684	689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187097	CGT	2	6	746	751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187097	CAG	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187097	GCA	2	6	871	876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187097	CTGT	2	8	2313	2320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NT_187097	TAAT	2	8	2377	2384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187097	TAA	2	6	2394	2399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187097	GTT	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187097	GGAAA	2	10	2480	2489	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187097	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187097	GAA	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187097	ATTT	2	8	2589	2596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187097	ATA	2	6	2597	2602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187097	TGC	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187097	CTT	2	6	2631	2636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187097	TGTC	2	8	2689	2696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NT_187097	AAT	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187097	GTA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187097	TGAA	2	8	2780	2787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187097	A	6	6	2820	2825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187097	TAG	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187097	CCAT	2	8	2934	2941	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NT_187097	CTGG	2	8	2947	2954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NT_187097	TCG	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187097	TCT	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187097	AAT	2	6	3894	3899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187097	TGATG	2	10	4013	4022	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187097	GTT	2	6	4038	4043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187097	CTGC	2	8	4066	4073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NT_187097	ACTG	2	8	4086	4093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NT_187097	CGT	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187097	CAG	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187097	AGTT	2	8	4233	4240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187097	TTA	2	6	4262	4267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187097	AAT	3	9	4268	4276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187097	CAG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187097	ATT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187097	ATG	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187097	GACT	2	8	5312	5319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NT_187097	ATT	2	6	5344	5349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187097	TGA	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187097	CTC	2	6	5404	5409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NT_187097	ACTTA	2	10	5421	5430	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NT_187097	GCA	2	6	5489	5494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187097	AGG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187097	GAC	2	6	5584	5589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187097	CGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187097	CGG	2	6	5690	5695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187097	TTG	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187097	CCA	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NT_187097	AT	3	6	5848	5853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.